Nghiên cứu: Trình tự thế hệ tiếp theo được có mục tiêu để nghiên cứu tính ổn định của cây trồng trong cây biến đổi gen

Chỉ thị của EU 2001/18/EC yêu cầu bất kỳ sự kiện biến đổi gen (GM) nào phải ổn định. Trong công việc hiện tại, một cách tiếp cận Công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) được nhắm mục tiêu sử dụng mã vạch để gắn thẻ cụ thể từng phân tử DNA riêng lẻ trong quá trình chuẩn bị thư viện đã được thực hiện để phát hiện các đột biến có tính đến nhiễu nền do lỗi khuếch đại và giải trình tự. Phương pháp này lần đầu tiên được chứng minh là có hiệu quả trong việc phát hiện các đột biến trong các mẫu tổng hợp được chuẩn bị với các trình tự P35S đột biến tổng hợp hoặc không đột biến được trộn lẫn theo các tỷ lệ khác nhau. Tính ổn định di truyền của một phần của chất kích thích P35S được nhắm mục tiêu phát hiện GM sau đó đã được phân tích trong các mẫu bột GM.

Một số đột biến tần số thấp đã được phát hiện trong trình tự P35S. Một số nucleotide bị đột biến nằm trong đoạn mồi và đầu dò được sử dụng trong xét nghiệm chẩn đoán P35S. Nếu hiện tại không phải là đột biến soma mà là trình tự tương đồng của một số đơn vị, những đột biến này có thể ảnh hưởng đến hiệu quả của xét nghiệm chẩn đoán PCR thời gian thực P35S. Phương pháp này có thể được thực hiện trong các nghiên cứu về tính ổn định di truyền của các chèn GM nhưng cũng để phát hiện các cây biến đổi gen nucleotide đơn được sản xuất bằng cách sử dụng các kỹ thuật nhân giống mới.

Nguồn: ncbi.nlm.nih.gov